Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HTTP42858 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HTTP42858 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HTTP42858 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HTTP42858 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HTTP42858 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HTTP42858 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HTTP42858 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HTTP42858 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTTP42858 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTTP42858 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTTP42858 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTTP42858 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTTP42858 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HTTP42858 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTTP42858 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms