Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NSG1P42857 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NSG1P42857 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSG1P42857 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSG1P42857 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSG1P42857 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
NSG1P42857 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NSG1P42857 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NSG1P42857 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NSG1P42857 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NSG1P42857 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NSG1P42857 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NSG1P42857 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSG1P42857 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSG1P42857 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NSG1P42857 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms