Protein–RNA interactions for Protein: P42336

PIK3CA, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CAP42336 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PIK3CAP42336 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PIK3CAP42336 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PIK3CAP42336 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms