Protein–RNA interactions for Protein: P41247

PNPLA4, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA4P41247 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PNPLA4P41247 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PNPLA4P41247 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms