Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MDH1P40925 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH1P40925 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH1P40925 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH1P40925 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH1P40925 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH1P40925 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MDH1P40925 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MDH1P40925 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MDH1P40925 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MDH1P40925 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH1P40925 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH1P40925 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH1P40925 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MDH1P40925 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MDH1P40925 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
MDH1P40925 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MDH1P40925 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
MDH1P40925 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MDH1P40925 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms