Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLH1P40692 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLH1P40692 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
MLH1P40692 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
MLH1P40692 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MLH1P40692 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
MLH1P40692 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MLH1P40692 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH1P40692 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH1P40692 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH1P40692 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH1P40692 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH1P40692 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MLH1P40692 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MLH1P40692 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MLH1P40692 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms