Protein–RNA interactions for Protein: P33991

MCM4, DNA replication licensing factor MCM4, humanhuman

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM4P33991 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCM4P33991 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM4P33991 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM4P33991 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM4P33991 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM4P33991 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM4P33991 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM4P33991 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM4P33991 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM4P33991 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM4P33991 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM4P33991 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM4P33991 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MCM4P33991 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MCM4P33991 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM4P33991 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM4P33991 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MCM4P33991 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms