Protein–RNA interactions for Protein: P32314

FOXN2, Forkhead box protein N2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN2P32314 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FOXN2P32314 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
FOXN2P32314 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FOXN2P32314 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms