Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
OTX2P32243 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
OTX2P32243 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
OTX2P32243 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
OTX2P32243 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
OTX2P32243 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
OTX2P32243 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
OTX2P32243 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
OTX2P32243 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms