Protein–RNA interactions for Protein: P30511

HLA-F, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain F, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-FP30511 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HLA-FP30511 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HLA-FP30511 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms