Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CDC27P30260 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC27P30260 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC27P30260 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC27P30260 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CDC27P30260 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CDC27P30260 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CDC27P30260 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CDC27P30260 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CDC27P30260 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC27P30260 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC27P30260 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC27P30260 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC27P30260 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CDC27P30260 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CDC27P30260 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CDC27P30260 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CDC27P30260 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CDC27P30260 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC27P30260 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC27P30260 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC27P30260 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CDC27P30260 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms