Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ECHS1P30084 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ECHS1P30084 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms