Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MARCKSP29966 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MARCKSP29966 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms