Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
LMOD1P29536 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
LMOD1P29536 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms