Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB2P29033 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GJB2P29033 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB2P29033 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GJB2P29033 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GJB2P29033 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GJB2P29033 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GJB2P29033 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GJB2P29033 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB2P29033 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB2P29033 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB2P29033 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB2P29033 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms