Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GCAP28676 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GCAP28676 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GCAP28676 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GCAP28676 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GCAP28676 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GCAP28676 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCAP28676 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
GCAP28676 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GCAP28676 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GCAP28676 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms