Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GABRB3P28472 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GABRB3P28472 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GABRB3P28472 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms