Protein–RNA interactions for Protein: P28336

NMBR, Neuromedin-B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMBRP28336 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NMBRP28336 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NMBRP28336 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMBRP28336 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMBRP28336 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NMBRP28336 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NMBRP28336 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NMBRP28336 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NMBRP28336 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NMBRP28336 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
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