Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HLA-DMAP28067 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HLA-DMAP28067 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms