Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PSMA5P28066 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PSMA5P28066 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms