Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LMO1P25800 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LMO1P25800 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMO1P25800 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LMO1P25800 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LMO1P25800 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMO1P25800 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO1P25800 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO1P25800 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO1P25800 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMO1P25800 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms