Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ATP2B4P23634 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
ATP2B4P23634 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ATP2B4P23634 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms