Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SCP2P22307 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2P22307 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2P22307 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2P22307 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2P22307 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2P22307 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SCP2P22307 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCP2P22307 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
SCP2P22307 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SCP2P22307 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SCP2P22307 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SCP2P22307 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SCP2P22307 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SCP2P22307 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SCP2P22307 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SCP2P22307 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SCP2P22307 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116 ms