Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SYT1P21579 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SYT1P21579 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SYT1P21579 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SYT1P21579 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SYT1P21579 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SYT1P21579 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SYT1P21579 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT1P21579 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT1P21579 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT1P21579 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT1P21579 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SYT1P21579 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SYT1P21579 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms