Protein–RNA interactions for Protein: P20700

LMNB1, Lamin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNB1P20700 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMNB1P20700 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LMNB1P20700 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
LMNB1P20700 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms