Protein–RNA interactions for Protein: P19320

VCAM1, Vascular cell adhesion protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCAM1P19320 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VCAM1P19320 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VCAM1P19320 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms