Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIG1P18858 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIG1P18858 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIG1P18858 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG1P18858 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG1P18858 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG1P18858 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG1P18858 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG1P18858 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIG1P18858 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIG1P18858 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIG1P18858 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIG1P18858 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIG1P18858 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG1P18858 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIG1P18858 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIG1P18858 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIG1P18858 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms