Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
RPL17P18621 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RPL17P18621 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RPL17P18621 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RPL17P18621 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RPL17P18621 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RPL17P18621 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL17P18621 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL17P18621 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RPL17P18621 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms