Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NELFEP18615 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NELFEP18615 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NELFEP18615 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NELFEP18615 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NELFEP18615 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NELFEP18615 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NELFEP18615 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NELFEP18615 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NELFEP18615 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NELFEP18615 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NELFEP18615 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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