Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PTPN1P18031 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTPN1P18031 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms