Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TCP1P17987 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TCP1P17987 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TCP1P17987 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TCP1P17987 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TCP1P17987 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms