Protein–RNA interactions for Protein: P17900

GM2A, Ganglioside GM2 activator, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GM2AP17900 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GM2AP17900 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GM2AP17900 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GM2AP17900 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GM2AP17900 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GM2AP17900 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GM2AP17900 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GM2AP17900 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
GM2AP17900 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms