Protein–RNA interactions for Protein: P17677

GAP43, Neuromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAP43P17677 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GAP43P17677 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAP43P17677 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAP43P17677 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GAP43P17677 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GAP43P17677 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GAP43P17677 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GAP43P17677 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GAP43P17677 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GAP43P17677 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GAP43P17677 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GAP43P17677 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GAP43P17677 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GAP43P17677 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GAP43P17677 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GAP43P17677 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GAP43P17677 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms