Protein–RNA interactions for Protein: P17405

SMPD1, Sphingomyelin phosphodiesterase, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPD1P17405 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SMPD1P17405 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SMPD1P17405 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMPD1P17405 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms