Protein–RNA interactions for Protein: P17039

ZNF30, Zinc finger protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF30P17039 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ZNF30P17039 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ZNF30P17039 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms