Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IL7RP16871 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IL7RP16871 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL7RP16871 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
IL7RP16871 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL7RP16871 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL7RP16871 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL7RP16871 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
IL7RP16871 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
IL7RP16871 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
IL7RP16871 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
IL7RP16871 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
IL7RP16871 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL7RP16871 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL7RP16871 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
IL7RP16871 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
IL7RP16871 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
IL7RP16871 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms