Protein–RNA interactions for Protein: P16520

GNB3, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNB3P16520 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
GNB3P16520 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
GNB3P16520 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
GNB3P16520 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
GNB3P16520 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
GNB3P16520 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GNB3P16520 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GNB3P16520 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GNB3P16520 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB3P16520 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB3P16520 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB3P16520 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB3P16520 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GNB3P16520 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms