Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDGFRAP16234 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDGFRAP16234 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms