Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFXP16104 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFXP16104 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms