Protein–RNA interactions for Protein: P15976

GATA1, Erythroid transcription factor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA1P15976 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATA1P15976 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATA1P15976 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATA1P15976 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATA1P15976 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GATA1P15976 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GATA1P15976 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms