Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TCF3P15923 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TCF3P15923 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TCF3P15923 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TCF3P15923 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF3P15923 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TCF3P15923 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TCF3P15923 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TCF3P15923 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TCF3P15923 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TCF3P15923 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms