Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC130P13994 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC130P13994 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms