Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PRG2P13727 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PRG2P13727 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PRG2P13727 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG2P13727 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG2P13727 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG2P13727 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms