Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VCANP13611 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VCANP13611 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VCANP13611 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VCANP13611 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VCANP13611 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VCANP13611 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VCANP13611 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
VCANP13611 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
VCANP13611 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
VCANP13611 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
VCANP13611 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
VCANP13611 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms