Protein–RNA interactions for Protein: P0DP02

IGHV3-30-3, Immunoglobulin heavy variable 3-30-3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-3P0DP02 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
IGHV3-30-3P0DP02 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
IGHV3-30-3P0DP02 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms