Protein–RNA interactions for Protein: P0CAP2

POLR2M, DNA-directed RNA polymerase II subunit GRINL1A, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2MP0CAP2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
POLR2MP0CAP2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
POLR2MP0CAP2 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
POLR2MP0CAP2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms