Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRR29P0C7W0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRR29P0C7W0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms