Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXB7P09629 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HOXB7P09629 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms