Protein–RNA interactions for Protein: P09238

MMP10, Stromelysin-2, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP10P09238 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
MMP10P09238 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
MMP10P09238 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
MMP10P09238 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
MMP10P09238 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
MMP10P09238 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
MMP10P09238 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
MMP10P09238 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
MMP10P09238 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP10P09238 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP10P09238 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP10P09238 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP10P09238 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
MMP10P09238 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
MMP10P09238 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MMP10P09238 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP10P09238 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP10P09238 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
MMP10P09238 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.57■■■□□ 2
MMP10P09238 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
MMP10P09238 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP10P09238 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
MMP10P09238 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
MMP10P09238 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
MMP10P09238 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms