Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MMP3P08254 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MMP3P08254 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MMP3P08254 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MMP3P08254 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP3P08254 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP3P08254 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP3P08254 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP3P08254 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP3P08254 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MMP3P08254 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP3P08254 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MMP3P08254 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP3P08254 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP3P08254 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP3P08254 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP3P08254 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP3P08254 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MMP3P08254 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MMP3P08254 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MMP3P08254 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MMP3P08254 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MMP3P08254 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms